基于28SrRNA基因序列对洛阳地区嗜尸性蝇类的分子鉴定     被引量：2

Molecular Identification of Sarcosaphagous Flies in Luoyang Based on 28S rRNA Gene Sequence

中文题名：基于28SrRNA基因序列对洛阳地区嗜尸性蝇类的分子鉴定

作者：赵琳琳 翟仙敦 张振 吕宙 夏志远 莫耀南

第一作者：赵琳琳

机构：[1]河南科技大学法医学院,河南洛阳471003;[2]西南政法大学刑事侦查学院,重庆400031

年份：2018

卷号：34

期号：2

起止页码：114-119

中文期刊名：法医学杂志

中文关键词：法医昆虫学;法医遗传学;嗜尸性蝇类;聚类分析;28S;r;RNA;死亡时间;洛阳;

摘要：目的通过检测嗜尸性蝇类28S r RNA基因中715 bp序列,鉴定常见嗜尸性蝇类种属,解决其形态学鉴定难题,为死亡时间推断提供技术支持。方法收集洛阳地区常见嗜尸性蝇类标本29只,经形态学鉴定后,用Chelex-100法提取腿部DNA,并对28S r RNA基因片段进行扩增和测序,与Gen Bank和EMBL数据库中的28条相应蝇种序列进行比对,用MEGA7.0软件进行序列整理,通过BLAST搜索进行序列比对,并分析所得序列碱基组成,建立种内及种间进化分歧率,构建系统发育树。结果形态学鉴定29只嗜尸性蝇类归属于3科5属6种。获得28S r RNA基因中715 bp的序列,在线BLAST比对结果显示相似度100%。系统发育树显示5种蝇类可以较好聚类。不同蝇种种间差异0.007~0.045,种内差异0~0.001,种间差异和种内差异没有交叉。结论 28S r RNA靶基因序列片段对嗜尸性蝇类有良好的鉴别能力,可以作为新的嗜尸性蝇类种属鉴定遗传标记。

分类号：DF795.1[法医基础科学]

收录：化学文摘（网络版）;CSCD:【CSCD2017_2018】；日本科学技术振兴机构数据库;生物医学检索系统;RCCSE;文摘与引文数据库;中国科技核心期刊;普通刊;